從對審計人員的要求看，經(jīng)過多年的積累和規(guī)范，項目審計有較固定的模式，對審計人員的要求主要集中在以財政財務(wù)知識為基礎(chǔ)，對各項會計準(zhǔn)則和審計準(zhǔn)則的正確把握。而審計調(diào)查不僅要求審計人員有查賬的知識，更側(cè)重與調(diào)查內(nèi)容相適應(yīng)的管理知識、專業(yè)知識、政策水平，要了解國家的大政方針等等。寫作水平相對要求高，調(diào)查報告不僅要揭示存在的問題，更要有問題的成因分析，要有調(diào)查結(jié)論和改進建議。
由于存在上述的不同，導(dǎo)致兩種方式發(fā)揮作用的效果不同。項目審計對問題的處理或評價是具體的，針對某事或某項具體行為，對被審計對象具體行為的糾正有較強的作用。對上級管理者而言，它能較具體地了解某單位某事項的情況，而審計調(diào)查涉及的面廣，層次高，政策性強。對被調(diào)查的個體而言，不出具具體行為的處罰糾正決定，但對領(lǐng)導(dǎo)和決策層而言，可以更好地發(fā)揮參謀作用，提供宏觀決策和政策調(diào)整的依據(jù)。
此外，兩種方式必要時可以互相轉(zhuǎn)換，項目審計發(fā)現(xiàn)的突出的、苗頭性、普遍性的問題，可以通過審計調(diào)查擴大信息量，分析深層次原因，為決策提供依據(jù)；審計調(diào)查中發(fā)現(xiàn)被調(diào)查單位有重大的違反國家財經(jīng)法規(guī)行為，審計機關(guān)認(rèn)為有必要進行審計處理、處罰的，可以立項審計，作出審計處理、處罰決定或移送有關(guān)部門。
由于專項審計調(diào)查目的性強，程序相對簡單，建議和結(jié)論層次高，所以專項審計調(diào)查對全面提高審計質(zhì)量、擴大審計影響往往可以起到事半功倍的效果。