4，業(yè)務(wù)范圍不同。
　　注冊會計(jì)師審計(jì)主要是財(cái)報(bào)審計(jì)，以財(cái)報(bào)審計(jì)拓展到代編財(cái)務(wù)信息，執(zhí)行商定程序、財(cái)務(wù)咨詢等活動。而內(nèi)部審計(jì)是以企業(yè)財(cái)務(wù)活動為基礎(chǔ)，拓展到以管理領(lǐng)域?yàn)橹鞯囊环N審計(jì)活動。
　　現(xiàn)在市面上的一些內(nèi)部審計(jì)的書主要講的不是財(cái)務(wù)審計(jì)方面的內(nèi)容，主要是避免與注冊會計(jì)師審計(jì)重復(fù)和有的內(nèi)部審計(jì)專家的錯誤觀念導(dǎo)至，但是索耶在期著作中明確告誡“在熱衷于這些審計(jì)所產(chǎn)生的有利影響時(shí)，絕不能走得太遠(yuǎn)，決不能乎視基本的財(cái)務(wù)審計(jì)和經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)審計(jì)”。
　　5，審計(jì)標(biāo)準(zhǔn)不同。
　　內(nèi)部審計(jì)的標(biāo)準(zhǔn)是公認(rèn)的方針和程序，注冊會計(jì)師的標(biāo)準(zhǔn)是會計(jì)準(zhǔn)則和相關(guān)法律法規(guī)。
　　6，專業(yè)勝任能力要求不同。
　　內(nèi)部審計(jì)要求具備一定的管理知識水平，由于內(nèi)部審計(jì)的目標(biāo)是幫助企業(yè)實(shí)現(xiàn)其目的，改善機(jī)構(gòu)動作并增加價(jià)值，故要求內(nèi)部審計(jì)人員具備一定的管理知識與水平。
現(xiàn)代企業(yè)內(nèi)部審計(jì)工作主要涵蓋的內(nèi)容
　　1、財(cái)務(wù)收支審計(jì)。主要是評價(jià)和監(jiān)督企業(yè)是否做到資產(chǎn)完整、財(cái)務(wù)信息真實(shí)及經(jīng)濟(jì)活動收支的合規(guī)性、合理性及合法性，對會計(jì)記錄和報(bào)表分析提供資料真實(shí)性和公允性證明；
　　2、經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)。是評價(jià)企業(yè)內(nèi)部機(jī)構(gòu)、人員在一定時(shí)期內(nèi)從事的經(jīng)濟(jì)活動，以確定其經(jīng)營業(yè)績、明確經(jīng)濟(jì)責(zé)任，這里包括領(lǐng)導(dǎo)干部任期經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)和年度經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)。
　　3、經(jīng)濟(jì)效益審計(jì)。審計(jì)重點(diǎn)是在保證社會效益的前提下
　　以實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)效益的程序和途徑為內(nèi)容，對企業(yè)的經(jīng)營效果、投資效果、資金使用效果做出判斷和評價(jià)，其中基建工程預(yù)決算審計(jì)應(yīng)為重中之重。
　　4、內(nèi)部控制制度評審。主要是對企業(yè)內(nèi)部控制系統(tǒng)的完整性、適用性及有效性進(jìn)行評價(jià)。
　　5、開展明晰產(chǎn)權(quán)的審計(jì)。審計(jì)明晰其產(chǎn)權(quán)歸屬，避免造成國有資產(chǎn)、集體資產(chǎn)流失或其他有損企業(yè)利益的行為。
　　6、其他審計(jì)。結(jié)合企業(yè)自身行業(yè)特點(diǎn)，開展對經(jīng)營、管理等方面的審計(jì)工作，以增強(qiáng)醫(yī)院后備能量。
內(nèi)部審計(jì)和自我評估體系
　　對于客觀性和公正性的需要（這一點(diǎn)對于銀行業(yè)內(nèi)審部門尤其重要）并不一定排除內(nèi)審部門參與咨詢或建議工作的可能性。由于需要對決策行為進(jìn)行控制，為確保管理層作出有根據(jù)的決策，建議高級管理層完善內(nèi)部控制常常是一種節(jié)省成本的做法。但是，其他形式的建議或咨詢應(yīng)當(dāng)是內(nèi)部審計(jì)基本職能的輔助性工作，因?yàn)閮?nèi)部審計(jì)是一項(xiàng)銀行內(nèi)部的獨(dú)立評估工作，用于審查和評價(jià)銀行的內(nèi)控體系（包括對財(cái)務(wù)報(bào)告過程的控制）。同時(shí)，即使內(nèi)審人員已經(jīng)建議高級管理層如何設(shè)置內(nèi)部控制，他們也可就高級管理層直接或指導(dǎo)下建立起來的內(nèi)控體系作出分析和評判。